Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN3Q9H649 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSUN3Q9H649 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN3Q9H649 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN3Q9H649 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN3Q9H649 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN3Q9H649 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NSUN3Q9H649 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN3Q9H649 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN3Q9H649 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSUN3Q9H649 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms