Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA6CQ9H3T2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA6CQ9H3T2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA6CQ9H3T2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms