Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNA10Q9GZZ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA10Q9GZZ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA10Q9GZZ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
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