Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR1EQ9GZS1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLR1EQ9GZS1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR1EQ9GZS1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms