Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REXO4Q9GZR2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
REXO4Q9GZR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REXO4Q9GZR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms