Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHCBP1LQ9BZQ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHCBP1LQ9BZQ2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms