Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SCAPERQ9BY12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SCAPERQ9BY12 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SCAPERQ9BY12 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms