Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL25A1Q9BXS0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL25A1Q9BXS0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL25A1Q9BXS0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms