Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP85Q9BW27 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP85Q9BW27 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP85Q9BW27 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms