Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAF4Q9BUZ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF4Q9BUZ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAF4Q9BUZ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms