Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EFHD1Q9BUP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFHD1Q9BUP0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms