Protein–RNA interactions for Protein: Q96T68

SETDB2, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB2, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB2Q96T68 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SETDB2Q96T68 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SETDB2Q96T68 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETDB2Q96T68 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms