Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCLRE1CQ96SD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DCLRE1CQ96SD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms