Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ALS2Q96Q42 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ALS2Q96Q42 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ALS2Q96Q42 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ALS2Q96Q42 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms