Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C8orf49Q96NF6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms