Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CABS1Q96KC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CABS1Q96KC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CABS1Q96KC9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CABS1Q96KC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms