Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDLIM2Q96JY6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDLIM2Q96JY6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDLIM2Q96JY6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms