Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC11Q96J66 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC11Q96J66 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms