Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC34Q96HJ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC34Q96HJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC34Q96HJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC34Q96HJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms