Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRELD1Q96HD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRELD1Q96HD1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRELD1Q96HD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms