Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDX27Q96GQ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX27Q96GQ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DDX27Q96GQ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DDX27Q96GQ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms