Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWCEQ96DN2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VWCEQ96DN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VWCEQ96DN2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VWCEQ96DN2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms