Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBGCP3Q96CW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP3Q96CW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms