Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXNL1Q96CM4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXNL1Q96CM4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms