Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF21AQ96BD5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF21AQ96BD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF21AQ96BD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF21AQ96BD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF21AQ96BD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PHF21AQ96BD5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF21AQ96BD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF21AQ96BD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms