Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RAB1CQ92928 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB1CQ92928 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB1CQ92928 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms