Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC12Q8WVT3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC12Q8WVT3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms