Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SFT2D1Q8WV19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFT2D1Q8WV19 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms