Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DTX3LQ8TDB6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DTX3LQ8TDB6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DTX3LQ8TDB6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms