Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC01555Q8NAE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC01555Q8NAE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms