Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTL3Q8N8U3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RTL3Q8N8U3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTL3Q8N8U3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms