Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M1

ATPAF2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF2Q8N5M1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATPAF2Q8N5M1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPAF2Q8N5M1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms