Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDXQ7Z353 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDXQ7Z353 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDXQ7Z353 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms