Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
STRCQ7RTU9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
STRCQ7RTU9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
STRCQ7RTU9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms