Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHST9Q7L1S5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHST9Q7L1S5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms