Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLPSL2Q6UWE3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLPSL2Q6UWE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms