Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LETMD1Q6P1Q0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LETMD1Q6P1Q0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LETMD1Q6P1Q0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms