Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOBEC3HQ6NTF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APOBEC3HQ6NTF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOBEC3HQ6NTF7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms