Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
OBSCNQ5VST9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms