Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SAMD5Q5TGI4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD5Q5TGI4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAMD5Q5TGI4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 796.6 ms