Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RIPPLY2Q5TAB7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY2Q5TAB7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY2Q5TAB7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms