Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NHSL1Q5SYE7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NHSL1Q5SYE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NHSL1Q5SYE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms