Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TIMM23BQ5SRD1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMM23BQ5SRD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms