Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WASHC2DQ5SRD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WASHC2DQ5SRD0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WASHC2DQ5SRD0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WASHC2DQ5SRD0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms