Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP47Q5SQN1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNAP47Q5SQN1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNAP47Q5SQN1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms