Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms