Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTU2Q2VPK5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTU2Q2VPK5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTU2Q2VPK5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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