Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT31Q15323 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT31Q15323 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms