Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDC1Q14676 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDC1Q14676 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDC1Q14676 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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