Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKRN4PQ13434 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MKRN4PQ13434 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MKRN4PQ13434 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
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